La squadra di tartarughe del ninja ha un nemico molto serio. Il suo nome è Savanti Romero. Questo cattivo ha costruito una macchina del tempo e ora raccoglie mostri di tutti i mondi: passato e futuro, per unirli in un enorme esercito malvagio. Gli eroi devono interferire con i piani del nemico. Per fare questo, dovranno visitare tutti i luoghi in cui Romero intende andare e neutralizzare tutti quelli che cerca di consegnare al suo fianco. Mike, Raphael, Leo e Donald sono pronti per viaggi pericolosi. Devi scegliere la prima coppia di candidati, saranno trasferiti nell'antico Egitto. Lì incontreranno mummie cattive. Dracula e zombi li stanno aspettando in altri luoghi non meno pericolosi del gioco Teenage Mutant Ninja Turtles Monsters Vs Mutants