Dopo la terza guerra mondiale, molte città giacciono in rovina. Le persone sopravvissute si sono unite in gruppi e ora stanno combattendo per la loro sopravvivenza. Nel gioco The Last Squad, comanderai una squadra di soldati che sono andati in cerca di cibo e medicine. Davanti a te sullo schermo vedrai i soldati della tua squadra, che si troveranno in uno degli isolati della città. Utilizzando uno speciale pannello di controllo, dirigerai le azioni di ogni soldato. Dovrai farli andare avanti. Non appena trovi il nemico, ingaggialo in battaglia. Usando varie armi leggere, granate ed esplosivi, dovrai distruggere il nemico e ottenere punti.