Un esercito di morti viventi invase il regno vegetale. Spostandosi lungo la strada verso la capitale, distrugge tutto sul suo cammino. In Plants vs Zombies TD comanderai la difesa della capitale. Una certa area sarà visibile sullo schermo di fronte a te. Dovrai identificare posizioni strategicamente importanti. Successivamente, utilizzando uno speciale pannello di controllo, costruirai strutture difensive in questi luoghi e alleverai soldati di fiori. Quando gli zombi si avvicinano a loro, le tue piante apriranno il fuoco e distruggeranno il nemico. Per ogni zombi ucciso, riceverai punti.