Una squadra di coraggiosi ricercatori parte per una spedizione spaziale alla ricerca di civiltà amichevoli nel Bubble Throw. Durante il volo, una certa sostanza ostile è entrata nella nave, che si riempie di bolle multicolori e minaccia di catturare la nave dall'interno. Gli eroi hanno scoperto che possono combattere l'invasione con palline dello stesso colore lanciandole e formando gruppi di tre o più identiche per la successiva distruzione. Per completare un livello in Bubble Throw devi ottenere il numero di punti richiesto. Ci sono un totale di cinquanta livelli nel gioco e la loro complessità è in costante aumento.