Un treno speciale che va dall'Antartide alla giungla potrebbe cessare di esistere, e il motivo è dovuto al deterioramento dei binari ferroviari. Gli animali, temendo di perdere l'unico mezzo di trasporto che permette loro di viaggiare, si sono rivolti a Diego per chiedere aiuto a Go Diego Go! Il salvataggio ferroviario di Diego. Il ragazzo è pronto ad aiutarti, coinvolgendoti nell'attuazione del suo piano. Si tratta di riparare la strada, ma prima devi mettere tutti gli animali nelle carrozze. I passeggeri accettano di viaggiare solo in compagnia dei propri simili, quindi c'è una carrozza separata per pinguini, cervi, orsi e così via. Quando tutti gli animali saranno stati posizionati, il treno inizierà il suo viaggio e prima di ogni fermata dovrai assemblare la strada come un puzzle girando le singole sezioni in Go Diego Go! Il salvataggio ferroviario di Diego.
