In un lontano futuro, gli scienziati hanno imparato a ridurre gli oggetti a dimensioni microscopiche. Oggi nel gioco Spore Hunter, hanno deciso di inviare il pilota su un aereo speciale per esplorare il micro mondo. Il tuo eroe dovrà volare lungo un certo percorso ed esplorare questo mondo. Le creature costituite da spore attaccheranno il nostro eroe. I numeri inseriti saranno visibili in essi. Significano quanti colpi devi fare alla creatura per distruggerla. Manovrando abilmente sulla tua nave, gli sparerai dalla tua arma e distruggerai le spore.