Un esercito di mostri ha invaso il regno dei piccoli elfi dei boschi. In Fruit Legions: Monsters Siege, guiderai la difesa del regno. Con l'aiuto di una cassetta degli attrezzi speciale dovrai coltivare fiori militari speciali. Dopodiché, dovrai esaminare la strada lungo la quale si muove l'esercito di mostri. Lungo di esso, in luoghi strategicamente importanti, dovrai posizionare questi fiori. Non appena i mostri appaiono, i tuoi fiori si attiveranno e inizieranno a sparare contro di loro. Distruggendo i mostri, riceverai punti. Avendo accumulato una certa quantità di essi, puoi coltivare nuovi fiori più potenti.