Un cielo cupo con nuvole sospese di uno strano colore, pozzanghere di liquido verde dall'odore sospetto ovunque, edifici fatiscenti e macchine rotte: questo è tutto ciò che resta della base un tempo attiva in Toxic Arena: Biological Threat. Si scopre che sul suo territorio sono stati condotti esperimenti segreti sulla mutazione umana. Quando si è verificata l'esplosione, l'area è stata contaminata e i mutanti sono emersi in superficie. Per localizzare la minaccia e impedire ai mostri di diffondersi nell'area, l'eroe è stato inviato ad eliminarli in Toxic Arena: Biological Threat.
