L'eroe del gioco Escape the Giant School 3D è diventato improvvisamente molto piccolo, ritrovandosi in una scuola che per lui era diventata gigantesca. Libri comuni, matite e una gomma si sono trasformati in ostacoli sul cammino del ragazzo e lui vuole lasciare velocemente la scuola che è diventata pericolosa. Aiutalo a superare gli ostacoli sotto forma di enormi articoli di cancelleria, libri di testo e altri oggetti che uno studente usa solitamente. Salta su gomme e matite, su libri e banchi, raggiungendo il traguardo per spostarti in una nuova posizione in Escape the Giant School 3D.