Nel mondo dei blocchi, scoppiò la guerra tra i due stati. Nel gioco Blocky Squad dovrai comandare le unità avanzate di uno degli stati che sono stati i primi a entrare nella battaglia. Per distruggere il nemico e salvare i tuoi soldati dovrai dimostrare il tuo talento di stratega. Prima di te sullo schermo puoi vedere il campo di battaglia. Con l'aiuto di un pannello speciale puoi chiamare i tuoi soldati. Ogni icona sul pannello è responsabile per i soldati con un tipo specifico di armi. Quando hai un piccolo distaccamento puoi mandarli in battaglia. Distruggendo il nemico, ti guadagneranno punti. Su di loro puoi chiamare nuove reclute o aprire nuovi tipi di soldati.