Una volta i cancelli infernali erano già stati rinchiusi, ma gli spiriti maligni non abbandonarono la speranza per liberare la loro strada e ci riuscirono dopo molti anni. Questa volta hanno aperto un portale su Marte nella speranza che gli umani non possano trovarlo immediatamente. Ma Marte è già stato colonizzato, numerosi laboratori biologici si sono stabiliti su di esso, e una massa di scienziati ha lavorato, tutti sono stati sottoposti all'attacco crudele dei mostri. La tua squadra radicale deve distruggere i mostri di Doom 3 e non devi fare esperienza. Vai sul pianeta rosso e stai attento, i mostri sono diventati più intelligenti e più forti.