Nel gioco Atom War andrai nel mondo in cui vivono le particelle più piccole, che chiamiamo atomi. In questo mondo è iniziata una guerra e tu ne prenderai parte. Vedrai il tuo atomo rosso sullo schermo di fronte a te. Avrà una certa dimensione e attorno ad esso sarà visibile un piccolo campo di forza. Intorno al tuo atomo, altre particelle inizieranno ad apparire con un colore blu. Dovrai esaminarli attentamente e trovare quelli che sono più piccoli delle dimensioni del tuo personaggio. Ciò significa che queste particelle sono più deboli del tuo atomo. Dovrai inseguirli e poi attaccare. Distruggendo l'atomo blu, riceverai punti e il tuo personaggio diventerà più grande e più forte.
