Il ragazzo ninja vuole dimostrare al suo insegnante che è pronto per sfide serie e che gli possono essere affidati compiti responsabili. Nel gioco Ninja Boy Flying, è andato segretamente in una zona pericolosa abitata da ladri e ogni sorta di elementi criminali. L'eroe intende percorrerlo a velocità e, dove è necessario superare ampi ostacoli, utilizzerà un volo planato. I nemici correranno verso di te e potrai saltarci sopra o eliminarli con un abile lancio di uno shuriken, una stella d'acciaio con spigoli vivi. Devi reagire rapidamente agli ostacoli e decidere ancora più velocemente come superarli in Ninja Boy Flying.