I ninja apparvero nel Giappone medievale e servirono come spie, esploratori e sabotatori da ricognizione. Indossavano abiti scuri, si coprivano il volto e operavano per lo più di notte, muovendosi silenziosamente e portando a termine i compiti assegnati. Tutti i ninja padroneggiavano l'arte del ninjutsu. Essenzialmente, i ninja sono un tipo di guerriero utilizzato in operazioni speciali, come le forze speciali giapponesi. Anche all'eroe del gioco Ninja Speed Runner viene affidata una missione segreta, quindi si muove rapidamente. Gli shuriken stanno volando verso di lui, da cui deve schivare e tu lo aiuterai in questo, costringendo l'eroe a saltare o abbassarsi in Ninja Speed Runner.
