Nell'antico Giappone esisteva un ordine militare specializzato in spionaggio e omicidi di varie persone. Erano chiamati ninja. Molte guerre dell'Ordine erano nel servizio segreto dell'Imperatore del Giappone. Oggi nel gioco Flight Of The Ninja, aiuteremo uno di loro nell'esecuzione di una missione segreta. Il tuo eroe deve entrare nel castello custodito, che sorge su una montagna. Per fare questo, dovrà scalare le pareti a strapiombo che sono piene di trappole. Il tuo eroe che usa ganci speciali scalerà abilmente il muro. Non appena raggiunge la trappola, facendo clic sullo schermo dovrà farlo saltare e saltare su un'altra parete.