In un lontano futuro, c'è una guerra nello spazio tra grandi corporazioni per le risorse che si trovano sui pianeti appena scoperti. Nel gioco Super Zaxxon come pilota di caccia, prendi parte a queste battaglie al fianco di una delle corporazioni. Sulla tua nave dovrai completare una serie di missioni per distruggere gli oggetti nemici. Davanti a te sullo schermo sarà visibile la base, che dovrai attaccare. Verrai sparato da pistole a terra, così come in aria verrai attaccato dalle navi nemiche. Manovrai abilmente sulla nave per tirarla fuori da sotto il colpo e attaccare in risposta. Sparando con precisione dalle tue pistole, abbatterai le navi nemiche e distruggerai vari bersagli a terra.