Nella terza parte del gioco Sonic Advance 3, continuerai ad aiutare il coraggioso Sonic e i suoi amici a combattere contro il folle Dr. Evil. Il pazzo vuole costruire un'intera città in cui crescerà dei mostri. Per farlo, avrà bisogno delle pietre del Caos. Sonic deve trovarli prima. Davanti a te sullo schermo sarà visibile il tuo personaggio e il suo compagno. Usando i tasti di controllo, controllerai le azioni di entrambi gli eroi contemporaneamente. Dovrai farli muovere nel luogo e ispezionare attentamente tutto. Cerca pietre e oggetti sparsi dappertutto e raccoglili. Sulla tua strada incontrerai ostacoli e trappole che i tuoi eroi dovranno saltare. Se incontrano mostri, i personaggi saranno in grado di aggirarli o distruggerli unendosi alla battaglia. Per aver ucciso gli avversari, ti verranno assegnati punti in Sonic Advance 3.
