L'eroe del gioco Murder Case Clue 3D è un ragazzo di nome Tom che ama i romanzi polizieschi. Ha letto tutte le opere su Sherlock Holmes e Hercule Poirot e sa esattamente cosa diventerà da grande. Il ragazzo sogna da tempo di indagare su un vero crimine. Ma chi glielo permetterà, perché è ancora adolescente. Tuttavia, la vita a volte riserva delle sorprese. Quando gli amici invitarono il ragazzo a trascorrere un fine settimana con loro in una casa di campagna, non aveva idea di come sarebbe potuta finire. Arrivato all'indirizzo specificato e trovata la casa desiderata, l'eroe la trovò vuota. Tutti gli amici se ne andarono per rilasciare dichiarazioni alla polizia perché in casa era avvenuto un omicidio. Mentre non c'era nessuno, il ragazzo ha deciso di indagare sull'incidente. Nessuno gli impedirà di cercare prove e tu lo aiuterai a stabilire rapidamente la verità in Murder Case Clue 3D.