Spesso gli eventi del passato si riflettono nel presente e ciò accade perché l'evento non ha trovato la sua conclusione logica o richiede vendetta. Questo è quello che è successo in Samurai Rurouni Wars con un samurai nello spirito, ma un vagabondo nell'essenza. Viaggia per il mondo combattendo i cattivi. In passato, suo padre fu tradito da coloro che non avrebbe mai creduto possibili e questo trasformò il samurai in quello che divenne: un ronin. Non vuole servire un padrone; la sua sorte è la solitudine e l'eterna lotta contro il male. Aiuterai l'eroe a spostarsi da un dominio all'altro per sradicare le sembianze malvagie dei crudeli samurai che sono passati al lato oscuro in Samurai Rurouni Wars.