Nel gioco Flappy Run Online si entra nel mondo in cui vivono creature che possono muoversi nell'aria. Oggi, la compagnia di queste creature ha deciso di fare un viaggio ed esplorare gli angoli remoti del loro paese. Alzandosi in volo, hanno volato lungo il percorso. Poi battono le ali e volano in avanti. Sulla strada del loro movimento incontreranno colonne e altri ostacoli. Se accade lo stesso, perdi e ricomincia il passaggio del gioco.
