L'eroe del gioco Counter-Strike: Reboot dovrà prendere parte a dodici missioni con il tuo aiuto. Poiché il contenuto è mantenuto strettamente segreto, gli obiettivi verranno rivelati man mano che completi la missione precedente. Il primo si chiama Alpha e il tuo compito è respingere l'attacco dei terroristi che vogliono catturare la tua base. In altre missioni dovrai svolgere altri compiti, come liberare ostaggi, distruggere basi terroristiche, rimuovere mine e così via. Tutte le missioni sono limitate nel tempo, devi risolvere i problemi in modo rapido ed efficiente in Counter-Strike: Reboot.
