L'acqua o qualsiasi altro liquido, seguendo le leggi della gravità, cola se trova una via d'uscita da solo, anche una piccola crepa. In Water Flow 3D devi lasciarlo fluire liberamente per riempire i contenitori quadrati sottostanti. Il numero di contenitori varierà, ma devi ricordare che al loro interno può essere versato solo liquido del colore corrispondente. Per fare ciò, aprire le persiane nell'ordine corretto. A volte devi mescolare liquidi e rompere pareti di vetro con palline pesanti in Water Flow 3D. Ci sono molti livelli e sono diversi nell'impostazione delle attività.