La vita nel Regno dei Funghi viene nuovamente sconvolta dal rapimento della Principessa Peach. Bowser non riesce a calmarsi e non riesce a inventare nulla di nuovo se non rapire la principessa. Mario in Super Mario Flash intraprenderà un viaggio per salvare una ragazza, questa non è la prima volta per lui e hai un motivo per partecipare nuovamente a un'avventura divertente. Guida Mario attraverso le piattaforme, saltando su funghi e tartarughe malvagie. Trova il grande agarico volante magico che trasformerà l'idraulico in Super Mario. Inoltre, sulle piattaforme puoi trovare un fiore magico, che rafforzerà anche l'eroe e gli darà forza in Super Mario Flash.
