Per gli appassionati del genere degli uccelli in volo, Flappy Ball 3D cambierà leggermente l'interfaccia e offrirà il controllo di una palla da basket invece che di un uccello. Non solo volerà in aria, supportato da te, ma dovrà anche tuffarsi nei cerchi rossi e questo è obbligatorio. Ad ogni tuffo verrà assegnato un punto vincente. Mentre voli tra gli anelli, appaiono i cuori. Prendili per riempire il grande cuore sulla barra orizzontale in alto. Quando sarà piena, dietro la pallina apparirà un cuore, che la accompagnerà costantemente. Se perdi il cerchio, la palla scomparirà e apparirà un cuore che potrai controllare. Se non ci fosse il cuore, il gioco Flappy Ball 3D finirebbe.