Nella seconda parte del gioco Virus Ninja 2, aiuterai un coraggioso guerriero ninja a combattere vari virus. Davanti a te sullo schermo ci sarà un campo da gioco in cui appariranno vari batteri. Si sposteranno in direzioni diverse e a velocità diverse. Per distruggerli dovrai usare una spada. Guarda attentamente lo schermo e guida gli oggetti con il mouse. Quindi, colpirai i batteri e li taglierai in pezzi. A volte bombe possono apparire tra questi oggetti. Non dovresti oscillarli.