Un uragano è passato sul villaggio dei Puffi in Puffi Bubble Story. E non era un vento qualunque, ma un tifone di bolle multicolori. Hanno spazzato via il villaggio dalla faccia della terra e hanno portato con sé anche diversi Puffi che non hanno avuto il tempo di nascondersi. È necessario restaurare il villaggio e salvare i Puffi, e coloro che hanno causato la distruzione aiuteranno. Spara alle nuvole di palline, abbattendo le palline. Per fare ciò, devi raccogliere tre o più bolle dello stesso colore una accanto all'altra. Per aver completato con successo un livello riceverai monete, che verranno utilizzate per ricostruire case e strutture. Se c'è un Puffo tra le bolle, salvalo in Puffi Bubble Story.
